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2012第25周记:被Josh的总结所启发

2012-06-23
Qingyang
本文 1542 字,阅读全文约需 5 分钟


似乎周记要详尽一点,才有用处。不但要有总结,还有有计划,还要有展望。这样的记录,不仅仅可以用作以后的参考,还可以用来做下一周的指南

工作
    这一周,主要是在跟Josh做BaseCamp,继续CPAC的文档和重建。我的主要任务其实是给CMP写文档,还有就是给CMP的各个Stages写testing 程序的 文档和Shell。目前,我只是草草的完成了前面一向。这里面有很多我不是特别懂的地方,但是我这个星期里面
  1.  学到了用Markdown 语言写Python程序的Docstring,并且通过特定的程序将Docstring转换成RST文档,再通过Sphinx 自动将RST文档转换成网页,这样的话,可已将Docstring转换成网页,这样就有了网页格式的文档了。
  2.  写了两个CMP stages的文档
  3.  学会了使用git。目前使用的还不是命令行,而是Mac下面的客户端。这样,我所有的开发工作都是在我的Mac上进行的。我的DropBox将满,已经放不了太多东西了。我所有的code基本上都放在了Mac上面的Project 文件夹。这个文件夹会在rocky和Github上有备份。其实也可以考虑google code的。
  4. 给Steve和Dan简单讲解了C-PAC的配置并且让他们开始自己运行C-PAC了。
  5. QC了一下Rockland Sample数据,Visual Inspection并没有发现特别差的数据。
  6. 下载了ABIDE数据, Yale和San Diego的数据,还没有来得及做任何操作。应该给这些数据做备份呀。
  7. 检查Pedsns和IPN的kswapd0过载的问题,基本的原因是太多的内存被拿去做了cache,导致内存不足,系统变慢,然后Kswapd0出来整理内存。 kswapd0不是系统变慢的原因,系统变慢和kswapd0过载同是内存不足的症状。值得注意的是,这个问题在Rocky和Gelert上都存在。

    下个星期,应该做的事情有
  1. Get ABIDE data ready for Adriana
  2. Talk to Ranjit about multi-site and multi-session suport of CPAC
  3. Get Dan report
  4. Meet with Kate and Mike about Debellis' project
  5. Process Twin's data
  6. Get data ready for Digit-Span & Development project 
  7. Write Doc for more CMP stages
  8. 督促Dan写User Manual
  9. 督促Steve做更多QC。

    到周末的时候,我应该可以完成这些
  1. 完整的ABIDE data Ready for Release/Process
  2. CPAC ready for Multi-site
  3. Dan gets his report
  4. Twin's data processed
  5. Data organized for Digit Span & development Project
  6. Start next step of Debellis study (MalTreatment Project)
  7. Have Dan Started User Manual first Draft.
个人生活方面可以记录的并不多
  1. 看了电影 
    • 那些年我们追的女孩 you are the apple for my eye
    • Snatch
  2. 买了个手推车
  3. 跑步两次
  4. 每天做俯卧撑至少50个,有时做两次。
  5. 参加了公司的party,照了些照片。
  6. 继续读了 《fifty shades of Grey》
  7. 另外注意的是要查H1B的情况,争取能把签证需要材料全部都弄好。
  周末,青青就会从巴西回来了,好开心!


原文地址 https://conge.livingwithfcs.org/2012/06/23/201225josh/
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